| 1 | Зенит СПб | 52 | 27 | 15 | 7 | 5 | 49 | 32 | 17 |  |
| 2 | Спартак М | 52 | 27 | 15 | 7 | 5 | 45 | 29 | 16 |  |
| 3 | ФК Москва | 46 | 27 | 13 | 7 | 7 | 34 | 29 | 5 |  |
| 4 | ЦСКА | 44 | 27 | 11 | 11 | 5 | 37 | 22 | 15 | |
| 5 | Сатурн МО | 44 | 27 | 11 | 11 | 5 | 33 | 24 | 9 | |
| 6 | Динамо М | 40 | 27 | 11 | 7 | 9 | 36 | 32 | 4 | |
| 7 | Локомотив М | 40 | 27 | 11 | 7 | 9 | 36 | 36 | 0 | |
| 8 | Амкар | 38 | 27 | 9 | 11 | 7 | 26 | 21 | 5 | |
| 9 | Томь | 31 | 27 | 7 | 10 | 10 | 34 | 33 | 1 | |
| 10 | Химки | 31 | 27 | 7 | 10 | 10 | 24 | 29 | -5 | |
| 11 | Рубин | 31 | 27 | 9 | 4 | 14 | 28 | 36 | -8 | |
| 12 | Спартак Нч | 30 | 27 | 7 | 9 | 11 | 27 | 33 | -6 | |
| 13 | Крылья Советов | 29 | 27 | 7 | 8 | 12 | 29 | 37 | -8 | |
| 14 | Луч-Энергия | 29 | 27 | 7 | 8 | 12 | 23 | 32 | -9 | |
| 15 | Кубань | 28 | 27 | 6 | 10 | 11 | 22 | 33 | -11 | |
| 16 | ФК Ростов | 14 | 27 | 1 | 11 | 15 | 16 | 41 | -25 | |
|
